被淹没的档案室是一个需要解谜与战斗结合的关卡。首先需要从地热山谷西北方向山脊进入，或通过观测站右侧返回该区域。关键点在于利用希腊火罐炸毁三处雕像支撑物，从而推倒雕像制造逃生通道。第一处爆破点附近就有两个火罐，直接引爆即可。第二处需游泳到水池对岸，用弓箭拉开闸门释放火罐，并通过套索箭改变其漂流路径至目标位置。第三处则需操作天平机关，将火罐绑在摇臂上调整平衡后引爆。
战斗环节中，获取阿特拉斯地图后会遭遇重甲兵围攻，可利用场景中的希腊火罐制造爆炸伤害。通过硫磺迷雾区域时视野受限，建议优先使用榴弹箭或毒箭清理扎堆敌人。潜水阶段需注意呼吸器获取后即可无限潜水，后续水道探索会更为顺畅。若遇到钱币收集问题，火堆旁石碑处的钱币需从左侧潜水或墙洞翻越，正面入口需炸开前地图的门才能通行。
先射击摇臂将其拉至面前，再释放火罐并用弓箭连接两者使天平倾斜。重复此步骤将另一侧摇臂绑定火罐恢复平衡，最后转动天平将火罐运送至对岸引爆。雕像倒塌后会出现不死军团追击，需快速完成跑酷逃脱。若后续需要返回收集物品，可通过地热山谷入口重新进入，但部分路径如木板坍塌处可能无法通行。
该关卡包含多个收集要素，如背包、文献和壁画。文献位于二层走廊，需通过绳索跳跃抵达；壁画则在主线逃脱路线的右侧洞穴内。若通关后无法返回特定区域，建议优先在任务过程中完成全收集。部分挑战任务如生人勿近需注意自动点燃的火罐伤害，而水中击杀敌人的挑战则需利用有限换气点规划路线。
