开启药铺，首先需要满足基础的解锁条件。普通药铺的建造并非从一开始就可用，玩家需要将府衙等级提升至24级，之后才能在营造菜单的生产分类中找到并解锁药铺建筑。建造一座药铺需要消耗一定的资源，包括550铜币、350份菜肴和300份原木，同时需要指派1名负责人和3名工人进行建造，整个过程耗时2小时30分钟。这是游戏内获取药铺这一基础生产建筑的标准途径。
药铺建成后，其生产效率与等级和生产时长选择直接相关。通过投入资源进行升级，可以显著提升其产出收益。根据计算，在所有生产时间选项中，选择60分钟的档位通常能获得最佳的单位时间收益。当药铺升至满级后，选择60分钟生产，扣除成本后的净收益约为每小时730铜钱，平均每名工人每小时贡献约365铜钱，这一效率高于30分钟、45分钟或75分钟等其他选项，属于性价比较高的长期收益选择。
若要追求药铺收益的最大化，尤其是在游戏后期的杭州府，合理的布局规划至关重要。杭州府的特色建筑便民商栈能够为周边的特定店铺提供双倍产出的增益效果，而药铺正是受益店铺之一。为了实现最大经济收益，玩家可以在保证杭州府四种特色商栈齐全的前提下，重点规划便民商栈的布局。大运河最右侧的两个L型港口区域陆地面积最大，是放置便民商栈的理想位置。围绕这两个商栈，尽可能多地建造药铺，例如布局25个药铺，并全部升至5级。在这种布局下，算上双倍增益，每小时可获得可观的铜钱收益，同时占用人口适中，适合定期上线管理的玩家。
除了玩家自行建造的普通药铺，游戏内还存在一个特殊的动态建筑保安堂药铺，其获取方式完全不同。保安堂药铺无法通过营造菜单建造，而是需要玩家完成杭州府相关的限时探险剧情明察暗访辨真伪才能获得。玩家需要先进入对应的活动地图，通过每日与居民对话收集线索，并通过侦查收缴获取铅银袋子等任务道具。在集齐所需证物并完成后续的清理迷雾、押送家丁、采集毒人参等一系列剧情任务后，即可最终获得保安堂药铺。该建筑放置于城中后，可每小时自动生产30份草药，提供稳定的资源补给。
